Domaine thématique du pôle

- Ingénierie des connaissances

Titre du projet

VigiTermes

AAP

ANR / TecSan

Contact Porteur

Univ. DSPIM (Département de Santé Publique et d’Information Médicale)

Contact Mail

rodrigues@univ-st-etienne.fr

Résumé

Le projet VigiTermes vise à améliorer l'environnement de travail des équipes de pharmacovigilance. Les outils et ressources développés sont intégrés sur une plateforme de gestion des connaissances couplée à des outils de fouille de texte pour améliorer l'accès, l'analyse et la documentation des cas de pharmacovigilance.Le projet

Objectif Général

L’objectif général du projet est de produire des outils pour le traitement et la documentation des données de pharmacovigilance. Nous souhaitons par conséquent étendre et valider des ressources ontologiques ainsi que des méthodes développées avant le début du projet par les différents partenaires. Ces outils et ressources seront intégrés au sein d'une plateforme commerciale pour la gestion des connaissances et la détection du signal en pharmacovigilance. Ce projet est donc basé sur l'application des technologies de l'information au domaine de la santé.

Objectif Sectoriel

La prévention des effets indésirables liés aux médicaments (EIM) est devenu un important enjeu de santé publique. Les EIM causent 3% des hospitalisations en France et sont une des dix principales causes de décès aux Etats-Unis. La pharmacovigilance a donc pour objet la détection, l’évaluation et la prévention des EIM. Les professionnels de santé envoient les déclarations des EIM aux centres régionaux de pharmacovigilance ou à l’unité de pharmacovigilance du laboratoire pharmaceutique qui commercialise le produit suspect.

Contenus Technologiques

Notre objectif consiste à étendre et valider des ressources terminologiques et des méthodes/outils développés par les partenaires du projet VigiTermes (définitions formelles des termes ATC, WHO-ART et MedDRA, méthode de recherche d'article) et à développer des outils pour la détection des signaux, l’extraction, l’analyse et la documentation des cas de pharmacovigilance et les rendre disponibles par le biais d'une plateforme industrielle.
Ces définitions ainsi que les outils associés seront intégrés dans un médiateur sémantique qui vise à modifier l’environnement de travail des pharmacovigilants. Les méthodes mises en oeuvre appartiennent à l'ingénierie des connaissances et à la fouille de texte. Le projet regroupe deux partenaires utilisateur publique (Centre collaborateur de l'OMS pour la pharmacovigilance, Centre de pharmacovigilance de l'HEGP), deux partenaires industriels développant des solutions informatiques pour la médiation sémantique (MONDECA) et la fouille de texte (TEMIS), quatre laboratoires de recherche publique possédant une expérience dans les domaines des terminologies médicales, des ontologies, de la fouille de textes et du traitement automatique des langues (StEtienne-DSPIM, INSERM-U872, Rennes1-EA3888, LORIA) et d'un institut spécialisé en ingénierie multilingue (INALCO).

Philosophie / Démarche

La pharmacovigilance a pour objet la détection, l’évaluation et la prévention des effets indésirables liés aux médicaments. La détection d'un signal en pharmacovigilance est basée sur 1) l'étude de cas de pharmacovigilance similaires codés en WHO-ART ou MedDRA pour les effets indésirables et ATC pour les médicaments, associés à un commentaire en texte libre 2) les résumés des caractéristiques produits (RCP) et 3) les articles de la littérature médicale. On constate une dichotomie entre éléments codés (cas de pharmacovigilance) et en langage médical (commentaires, RCP et articles).

Enjeux

Nous n'avons pas connaissance d'un autre projet sur la gestion des connaissances terminologiques et bibliographiques qui gère l’ensemble de l’environnement de travail du pharmacovigilant. Le développement d'une ressource terminologique et ontologique pour les événements indésirables et les médicaments est un point fort du projet. La mise en oeuvre d’une telle ontologie dans un médiateur sémantique, pour améliorer l’accès à une base de données médicale, reste un domaine de recherche peu exploré. Le médiateur sémantique et les outils d'assistance à la documentation restent à développer pour l’accès aux ressources liées à la pharmacovigilance. Enfin, notre plate-forme sera en mesure d’intégrer des outils de fouille de données et de fouille de texte qui permettront d’accélérer la recherche et l’identification des EIM.

Nouveaux Produits/Services à Court/Moyen Terme

Le produit final du projet consiste en une plateforme intégrée de gestion des connaissances associée à des outils de fouille de texte destinée aux pharmacovigilants de l'industrie pharmaceutique et des autorités compétentes.

Principes Structurants

• Mondialisation de la gestion des cas de pharmacovigilance (sous l’égide de l’OMS)
• Existence et disponibilité pour les pays cibles des ressources terminologiques nécessaires
• Universalité de la représentation de la connaissance en pharmacovigilance

Résultats / Livrables

Les livrables sur le projet sont les suivants :
• Rapport sur les ressources terminologiques existantes, sur un état de l’art des méthodes de text mining et de gestion de terminologies multilingues
• Spécifications fonctionnelles et techniques d’une plateforme d’assistance à la documentation des cas de pharmacovigilance
• Ressources textuelles annotées et prototype pour la réalisation des tests et de la validation amont des spécifications
• Rapport sur l’évaluation de la qualité
• Première version opérationnelle d’une plateforme intégrée, incluant la documentation
• Rapports de coordination et d’avancement